Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF9P41273 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms