Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC1P41238 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms