Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PBX1P40424 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PBX1P40424 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PBX1P40424 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX1P40424 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX1P40424 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX1P40424 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms