Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms