Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms