Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms