Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD40LGP29965 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms