Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTKP29376 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTKP29376 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LTKP29376 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTKP29376 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LTKP29376 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTKP29376 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTKP29376 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTKP29376 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LTKP29376 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LTKP29376 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
LTKP29376 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTKP29376 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTKP29376 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTKP29376 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTKP29376 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTKP29376 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms