Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTX3P26022 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTX3P26022 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTX3P26022 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTX3P26022 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTX3P26022 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTX3P26022 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTX3P26022 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTX3P26022 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms