Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNCP24863 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNCP24863 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNCP24863 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNCP24863 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms