Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5F1P24539 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms