Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA2P24043 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA2P24043 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA2P24043 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms