Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF4P23510 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFSF4P23510 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms