Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCP20941 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCP20941 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCP20941 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCP20941 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCP20941 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCP20941 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCP20941 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms