Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP4AP20648 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP4AP20648 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms