Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB4AP20338 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms