Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDSP20132 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDSP20132 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDSP20132 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDSP20132 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDSP20132 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SDSP20132 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDSP20132 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDSP20132 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDSP20132 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDSP20132 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms