Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A1P19634 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms