Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATF4P18848 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATF4P18848 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATF4P18848 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATF4P18848 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATF4P18848 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF4P18848 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF4P18848 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF4P18848 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF4P18848 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms