Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL17P18621 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL17P18621 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL17P18621 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL17P18621 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL17P18621 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms