Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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PDE6GP18545 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDE6GP18545 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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