Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRAFP15056 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRAFP15056 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRAFP15056 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRAFP15056 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms