Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2P10911 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2P10911 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2P10911 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCF2P10911 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCF2P10911 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms