Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHGAP10645 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHGAP10645 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHGAP10645 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHGAP10645 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHGAP10645 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHGAP10645 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHGAP10645 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHGAP10645 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHGAP10645 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHGAP10645 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHGAP10645 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHGAP10645 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHGAP10645 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHGAP10645 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHGAP10645 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHGAP10645 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHGAP10645 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHGAP10645 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHGAP10645 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms