Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COX5BP10606 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COX5BP10606 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COX5BP10606 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COX5BP10606 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms