Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms