Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD3P0DMS9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms