Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM6P0DI80 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms