Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC175P0C221 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC175P0C221 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms