Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP1P09874 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP1P09874 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PARP1P09874 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARP1P09874 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARP1P09874 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP1P09874 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP1P09874 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP1P09874 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP1P09874 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARP1P09874 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP1P09874 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP1P09874 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms