Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PKHD1P08F94 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PKHD1P08F94 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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