Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFPP02771 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFPP02771 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFPP02771 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFPP02771 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFPP02771 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFPP02771 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFPP02771 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFPP02771 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms