Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F2P00734 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F2P00734 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F2P00734 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F2P00734 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F2P00734 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F2P00734 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F2P00734 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms