Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24AO95486 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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SEC24AO95486 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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SEC24AO95486 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SEC24AO95486 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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SEC24AO95486 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24AO95486 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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