Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAMP4O75379 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms