Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIN3BO75182 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3BO75182 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3BO75182 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3BO75182 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3BO75182 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIN3BO75182 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIN3BO75182 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIN3BO75182 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIN3BO75182 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIN3BO75182 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIN3BO75182 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms