Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MTSS1O43312 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTSS1O43312 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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