Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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