Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRXO43186 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRXO43186 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRXO43186 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRXO43186 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRXO43186 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRXO43186 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms