Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASKO14936 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASKO14936 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASKO14936 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASKO14936 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASKO14936 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms