Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3C2AO00443 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms