Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAP23O00161 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNAP23O00161 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms