Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBXN8O00124 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms