Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
J3QKU1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
J3QKU1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
J3QKU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QKU1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QKU1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QKU1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QKU1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QKU1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QKU1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms