Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
I3L4J1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
I3L4J1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
I3L4J1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
I3L4J1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
I3L4J1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
I3L4J1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
I3L4J1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
I3L4J1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
I3L4J1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
I3L4J1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
I3L4J1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
I3L4J1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
I3L4J1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
I3L4J1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
I3L4J1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
I3L4J1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms