Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C417 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C417 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H7C417 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H7C417 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H7C417 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H7C417 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C417 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C417 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C417 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C417 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C417 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C417 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C417 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms