Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf172C9J069 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf172C9J069 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms