Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRDCB7Z8K6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms