Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4E1Z4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4E1Z4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B4E1Z4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4E1Z4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4E1Z4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4E1Z4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4E1Z4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4E1Z4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms