Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DSR2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DSR2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DSR2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DSR2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DSR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DSR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DSR2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms